Впрочем, начало фильма далеко не столь очевидное. Два человека, Пэйтон и Бауэр, пробуждаются от длительного анабиоза на борту незнакомого им космического корабля. Куда он летит, какую миссию выполняет, когда достигнет точки прибытия, как они оказались здесь – всё это Бауэру и Пэйтону неизвестно. Получить ответы они могли бы на капитанском мостике, но проход туда заблокирован.
Пытаясь разобраться в происходящем, Бауэр узнаёт, что их корабль является спасительным ковчегом, на котором небольшое количество избранных летит на иную планету, чтобы попробовать основать там вторую Землю. Полёт должен был продлиться 123 года, однако что-то нарушило этот план спасения. Неконтролируемый ныне ковчег летит в неизвестность, и судьба человека, как вида, висит буквально на волоске.
Кроме того, Бауэр обнаруживает на борту корабля странных и смертельно опасных существ, с которыми ему вынуждено приходится вступать в противоборство, чтобы выжить. В этих непростых условиях, стеснённые как во времени, так и в возможностях, Бауэр с Пэйтоном должны как можно скорее взять ковчег под контроль, чтобы спасти жизни тех нескольких тысяч человек, мирно дремлющих в анабиозных камерах и ожидающих прибытия на новую планету, которое вполне может не состоятся.